Wilayah Ekologis Chili
Mencakup hampir 2.700 mil dari utara ke selatan, wilayah Chili termasuk gurun panas, padang rumput dingin, dan hutan tropis. Ekoregion Chili sebagian besar unik untuk ekosistem Amerika Selatan dan membentang ke tetangga Chili seperti Bolivia dan Argentina. Flora dan fauna di daerah ini menunjukkan tingkat endemisme yang tinggi, dan sebagian besar ekoregion memiliki tumbuhan dan hewan yang hanya ditemukan di wilayah tersebut. Wilayah ekologis Chili, sesuai klasifikasi World Wide Fund for Nature, dilihat di bawah ini.
Gurun Atacama
Wilayah ekologi Gurun Atacama diklasifikasikan di bawah Biara Gurun Pasir dan Gurun Xeric. Gurun Atacama membentang di sepanjang pantai barat laut Samudra Pasifik di Chili. Di sebagian besar gurun, curah hujan belum dicatat. Gurun ini secara khas gersang dan tandus, dengan dataran berbatu, pasir, dan danau garam di sebagian besar wilayah di dalam gurun. Rentang Andes dan menara Rentang Pesisir Chili di sekitar gurun dan mencegat awan menuju hutan belantara, sebuah situasi yang selanjutnya mencegah curah hujan di padang pasir.
Ada sejumlah kecil flora dan fauna di hutan belantara, dengan tingkat keanekaragaman hayati yang relatif rendah karena kondisi yang sangat kering. Flora seperti kaktus dan mesquite terjadi di daerah di mana air telah menumpuk. Hewan di wilayah tersebut telah beradaptasi dengan kondisi gersang dan telah mengembangkan tingkat endemisme yang tinggi. Amfibi termasuk spesies kadal, mamalia termasuk spesies tikus dan rubah, dan spesies burung termasuk sparrow lagu Peru, bintang kayu Chili, bumi berkarat putih lebih dalam, dan rumput biru-hitam Pasifik. Curah hujan sesekali mendorong pertumbuhan vegetasi seperti thyme rumput garam, Ephedra breana, Oxalis gigantean, dan Croton Chilensis.
Gurun adalah rumah bagi endapan mineral seperti tembaga, dan lingkungannya sangat dipengaruhi oleh kegiatan penambangan. Mineral-mineral ini memicu Perang Pasifik pada abad ke-19 antara Chili dan Bolivia, karena kepemilikan gurun pasir. Cadangan lingkungan di kawasan ini adalah Cagar Nasional La Chimba, Taman Nasional Pan de Azucar, dan Cagar Nasional Pampa del Tamarugal.
Puna Kering Andes Tengah
Wilayah ekologi ini diklasifikasikan dalam Montane Grasslands dan Shrublands Biome. Wilayah ini terletak di Andes Selatan yang tinggi dan membentang antara Chili, Bolivia, dan Argentina. Ekoregion ini adalah rumah bagi puncak-puncak yang tertutup salju, dataran tinggi, gunung berapi dan danau garam. Wilayah ini menerima kurang dari 400 milimeter curah hujan setiap tahun, dan flora dan fauna yang ditemukan di sini menunjukkan tingkat endemisme yang tinggi.
Flora Puna Kering Andes Tengah ditandai oleh tumbuhan alpine tropis, semak belukar, Yareta, dan spesies Polylepsis yang terkenal, tanaman kayu yang ditemukan di ketinggian tertinggi di dunia. Wilayah ini adalah rumah bagi banyak mamalia seperti kucing gunung Andes, Andean fox, cougar, vicuna, puma, IIamas, dan quirquincho. Spesies Flamingo di wilayah ini adalah flamingo James, Flamingo Andean, dan Flamingo Chili. Burung endemik ke wilayah ini termasuk cinclodes kerajaan, tit-tryant dada-Ash, dan finch berekor pendek. Sebagian besar burung-burung ini telah diklasifikasikan sebagai terancam punah.
Deforestasi, penggembalaan berlebihan oleh ternak, dan perubahan lahan oleh manusia telah membuat ekoregion terancam punah. Cadangan di wilayah ini termasuk Cagar Alam Faunal Eduardo Avaroa Andean dan Taman Nasional Sajama, yang didirikan untuk melindungi fauna yang ditemukan di daerah tersebut.
Hutan Hujan Beriklim Valdivian
Wilayah ekologis ini diklasifikasikan ke dalam Biome Hutan Beriklim Sedang dan Hutan Campuran. Daerah ini unik untuk Amerika Selatan, di Chili dan Argentina. Hutan hujan sedang di Valdivian menyerupai, sebagian, Pantai Pasifik Amerika Utara. Wilayah ini dicirikan oleh pohon berbunga hijau berdaun lebar. Wilayah ini berbatasan dengan Samudra Pasifik di barat dan Cordillera Andean di timur. Isolasi wilayah tersebut telah menyebabkan endemisme tingkat tinggi di antara flora dan fauna.
Pudu yang terancam punah, rusa terkecil di dunia, ditemukan di sini bersama marsupial arboreal yang dikenal sebagai kodod, dan burung pelatuk Magellan. Pohon yang dominan adalah sungsang Antartika bersama pohon-pohon lain seperti pohon puzzle monyet, konifer, podocarps dan cemara guaitecas. Deforestasi besar-besaran dan transformasi lahan menjadi perkebunan tanaman membuat kawasan ini memiliki keanekaragaman hayati yang terancam punah. Upaya konservasi di wilayah tersebut dilakukan melalui cadangan seperti Taman Nasional Valdivia, Taman Nasional Puyehue, dan Taman Nasional Alerce Costero.
Stepa Andean Selatan
Wilayah ekologi Andes Stepa Selatan diklasifikasikan di bawah Montane Grasslands dan Shrublands Biome. Ekoregion terletak di dataran tinggi pegunungan Andes dan membentang di sepanjang perbatasan Argentina dan Chili. Daerah ini sebagian besar kering, dengan iklim gurun yang dingin. Wilayah ini ditandai oleh semak, semak gugur, dan padang rumput. Tumbuhan di wilayah ini memiliki tingkat endemisme yang tinggi seperti bunga untuk menarik penyerbuk. Spesies hewan di daerah tersebut termasuk puma, rubah Andean, guanaco, dan vicuna. Ekoregion belum mengalami degradasi lingkungan, terutama karena tidak cocok untuk pertanian. Sebagian besar ekoregion juga dilestarikan di taman dan cagar. Peningkatan nyata dalam ekowisata, terutama di pegunungan di kawasan itu, terus mengancam kelestarian lingkungan di wilayah tersebut
Wilayah ekologis lain yang ada di Chili termasuk Arid Puna, Kompleks Gurun Atacama-Sechura, Kompleks Andean Tinggi Bolivia, Matorral Chili, Pulau Chiloe, Kepulauan Chonos, Kepulauan Juan Fernandez, Kepulauan Juan Fernandez, Hutan Temperate Kepulauan, Kompleks Hutan Magallanes-Ultima, Magellanic Hutan Subpolar, Chili Mediterania Utara, Gurun Pesisir Pasifik, Rumput Patagonian, Steppe Patagonian, Rapa Nui dan Sala-y-Gomez Hutan Tepi Lebar Subtropis Hutan, Hutan Kepulauan San Felix-San Ambrosio Hutan Iklim, Gurun Sechura, Chili Mediterania Selatan, Tierra del Fuego Rio Grande Complex, dan Valdivian.
Wilayah Ekologis Chili
| Kawasan Ekologis Chili (sesuai World Wide Fund for Nature) | Bioma |
| Puna Kering | Air Tawar Andes Tinggi |
| Gurun Atacama | Gurun dan Semak Xeric |
| Kompleks Gurun Atacama-Sechura | Air Tawar Atacama |
| Kompleks Andes Tinggi Bolivia | Air Tawar Andes Tinggi |
| Puna Kering Andes Tengah | Padang Rumput Montane dan Semak |
| Matorral Chili | Hutan Mediterania, Hutan, dan Lulur |
| Pulau Chiloe | Air Tawar Chili Selatan |
| Kepulauan Chonos | Air Tawar Chili Selatan |
| Kepulauan Juan Fernandez | Air Tawar Kepulauan Juan Fernandez |
| Hutan Kepulauan Pulau Juan Fernandez | Hutan Beriklim Sedang dan Hutan Campuran |
| Kompleks Magallanes-Ultima Esperanza | Air Tawar Chili Selatan |
| Hutan Subpolar Magellan | Hutan Beriklim Sedang dan Hutan Campuran |
| Mediterania Mediterania Utara | Mediterranean Chile Freshwater |
| Gurun Pesisir Pasifik | Pacific Coastal Desert Freshwater |
| Padang Rumput Patagonian | Padang Rumput Beriklim sedang, Sabana, dan Semak |
| Patagonian Steppe | Padang Rumput Beriklim sedang, Sabana, dan Semak |
| Hutan Rapa Nui Rapa Nui dan Sala-y-Gomez | Hutan Daun Basah Tropis dan Subtropis |
| Hutan Beriklim Kepulauan San Felix-San Ambrosio | Hutan Beriklim Sedang dan Hutan Campuran |
| Gurun Sechura | Gurun dan Semak Xeric |
| Mediterania Selatan Chili | Mediterranean Chile Freshwater |
| Stepa Andean Selatan | Padang Rumput Montane dan Semak |
| Kompleks Tierra del Fuego-Rio Grande | Patagonia Freshwater |
| Orang Valdivian | Air Tawar Chili Selatan |
| Hutan Hujan Beriklim Valdivian | Hutan Beriklim Sedang dan Hutan Campuran |
